布莱克将军身在北美监狱却心系震远他们的战斗,从狱卒口中他得知了全世界的魔军都在向天维集中,他虽然还不知道震远此次的战略用意,但在这样的局势下布莱克很担心震远他们的安全,内心的不安促使他必须想办法离开这里立即赶去天维帮忙,就在他思考如何离开之时,魔军攻到了监狱造成严重的混乱,布莱克遂趁乱越狱,他夺取了监狱内的一架超速战机,打算赶回山垒想办法去天维支援震远。虽然目前各地的战斗仍在继续,但天维却已是十分危险,魔军大批步兵和攻城兵器组成的军团在铁流军团和魔军及巴蛇决战之时绕过霍将军的防线来到天维外墙,天兵部队依靠堡垒般的城墙顽强抵抗,随后魔帝见部队已经打到天维却久攻不下,明白天维的防御外墙也是灵钢所铸,此时的魔帝嚣张气焰正旺,他决定不用任何战术直接从正面突破天维的防御,以此展现他强大的力量,他不再观战而来到天维总部前,通过黑暗令牌释放出大量黑色粒子散播开来,而后令牌落地黑色粒子爆炸,一瞬间就消灭了外墙周边所有的军队,击破正大门和天网并破了镇魔壁的法力,魔军顺势涌入天维基地,魔帝随即在天空打开一个传送门,召来更多的黑甲军、御林军和大批空中恶魔清理天维,而现在震远还需要一阵才能完成强化。此时天维基地内天兵正在依托各种防御建筑和设施全力抵挡魔军,尽量再拖延些时间,魔军空中恶魔群扑向天维总部,却遭遇了地面防空力量和及时赶回的兰羽驾驶的雀王舰及六架银翼战机阻拦,双方在基地上空混战。外墙前苍狼将军巴特尔带领他的骑兵团来和魔军作战,就在骑兵团支持不住的时候,叶莲娜带领的冬日军团和俄国精锐联军力量、卡尔带领的黑曜石部队,克里斯和西门将军带领的海军陆战队、佩斯星希尔将军带领的佩斯星精锐陆军部队、埃及兄妹带领的法老护卫队、兽族诺尔王子带领的兽族陆军、植物族允儿公主带领的精灵战士和树人军团、黄雷将军的重甲兵团和葛将军的铁翼舰队全部抵达天维,魔界众将也都来了,影刃王带着五位将军和他们最后的部队协助众人一起对抗魔帝的军队,这时太极将军带太极特战队也赶到天维助战,大家现在只有一个目标,就是竭尽全力阻止魔帝前进,不惜一切防御天维。可众人的极力阻拦却招来魔帝的怀疑,很明显众人这是在拖延时间,反正天网已经消失自己可以用魔眼观察天维内部,他看到了震远在神视大厅强化九州之心后非常吃惊,而后顿时明白了震远他们一直没出战不是因为害怕自己,而是准备以最初始的办法消灭自己。
震远这边很快就可以出战了,可魔帝发现众人和震远的意图后随即全力冲破众人的阻拦来到天维广场,可四灵战王重伤未愈,震远为了之后和魔帝的决战让战芸不要出击保存实力,让雪月星廉两人去协助众人阻拦魔帝,随即两人分别释放最强招式心灵风暴和七星连珠,但都被魔帝轻易破解,两人以大法力合力一击,但被迫切要阻止震远完成强化的魔帝再次击败,魔帝看着两人想起了威力巨大的歼灭大阵,为了让这个阵法永远不能再布成他欲杀两人。夏彤想到办法,魔帝此刻注意力都在两人身上,她让雪月控制住魔帝,自己调整天网灵能炮的角度瞄准后向魔帝发射,但魔帝用令牌挡住光束并以黑暗能量将光束顶回去继而炸毁了发生器,魔帝想一举摧毁天网灵珠但雪月急中生智用意念控制灵珠并将神视大厅侧面的灵钢玻璃打破,将灵珠扔进神视大厅随即被众人保护起来。魔帝为了不浪费时间放弃摧毁灵珠而步步逼近大楼脚下的雪月星廉,五行神将请命出战阻拦魔帝救回两人,震远一开始不允许,这么多人都没挡住魔帝,他们去只能是送死,震远已经看到太多伤亡,此刻他不想再让人为自己白白牺牲。皇甫钧他们表示自从知道自己注定要成为炮灰之后早已做好心理准备为世界牺牲自己,布阵的时候他们本该死去的,是由于魔帝作梗才让他们活了下来,如果现在用他们的生命可以换来浩劫的终结他们愿意牺牲自己,这种牺牲很有价值,再光荣不过了,他们都坚信震远一定能成功铲除魔帝。最后震远虽然舍不得五行神将,但也不能眼见雪月星廉被杀而无动于衷,迫于无奈震远还是允许他们去了,他们只要再抵挡魔帝五分钟自己即可完成融炼,五人发挥全力和魔帝展开激烈地缠斗,并且将雪月和星廉救回神视大厅,虽然五行神将最终完成了任务拖住了魔帝五分钟,但却是以他们的生命为代价,这让所有人都非常悲痛,尤其是星廉,因为战死的都是他在这个世界上最亲的人。
大批的暗黑御林军步兵已经在天维广场上集结完毕,而各路援军还在城墙外和魔军部队激战以减轻基地内的压力。布莱克此刻已经回到山垒找回他的手杖,并打开军火库密室取走前不久研发成功的最新型黑曜石灵能武器原型枪,随后立即乘坐隐藏在自己山垒地下密室应急用的先进飞行器以最新的灵能折跃技术火速赶去天维援战。这时震远终于完成强化,遂以光明核心的大法力瞬间治愈四灵战王和雪月星廉(就像在魔宫时光明核心治愈了自己一样,而后在第二部中兰羽据此研制出灵能治疗技术),魔帝开始攻击总部大楼,但被大楼前端的灵能护盾挡住,魔帝说震远他们缩在里面不敢出来,震远听到后随即下令众人和黄金卫队、天羽卫队以及天维总部内所有天兵部队随自己立即出战,这次是最后的机会,无论如何也必须消灭魔帝,不能让五行神将和外面那些将士们白白牺牲。魔帝发现言语刺激无用后于是失去耐性,集中力量到令牌尖端准备一举摧毁整个总部大楼,就在这千钧一发之际震远释放权杖二式抵消了魔帝的攻击,随即和众人一起在黄金卫队的护卫下走到检阅平台上,天兵立即展开部署和魔军形成对峙,天羽卫队隐身占据制高点随时支援众人,此时天翔看到眼前的情景感叹到真是黑云压城城欲摧啊,而震远接着说甲光向日金鳞开,各位,我们上。魔帝利用四战王、雪月、星廉、震远、战芸八人此刻内心深处多多少少存在的恐惧感而以负能量打造出八个和八人能力相当的黑暗战士,随后立刻下令全军攻击,黄金卫队在台阶最高处极力抵挡,随后开始和魔军近战,大股天兵从基地各个出口涌出并依托四座防御大楼、各种残存的建筑同魔军缠斗,黑暗战士很厉害,而且越战越勇,时间一分一秒地过去,而众人还没和魔帝对抗就被压制。随后震远在打斗中感知到那些黑暗战士应该就是众人内心恐惧感的实体化,于是试着让自己的心平静下来无惧无畏,闭上眼睛无视黑暗战士的进攻,当它再次攻击到自己时就自然消失了,战芸见状也和震远一样平心静气,攻击她的黑暗战士也消失了,接着众人纷纷效法,但有些人实在难以做到心中毫无恐惧,于是震远他们转过头帮他们将之解决,八个黑暗战士不到五分钟就全灭了。魔帝只好亲自上阵,震远和战芸立刻进入无限境界联手和魔帝决战,虽说两大光明力量合力十分强大,但还是很难压制住魔帝只能与之持平,魔帝发挥全力击伤两人,准备以纯黑暗能量对他们进行致命一击,关键时刻布莱克将军通过折跃赶到,将飞行器提前设定好自动撞向魔帝以暂时阻止其再出手,同时用喷射背包将自身弹出。震远等人对布莱克的支援万分惊讶,震远说你不是在蹲监狱吗,布莱克说他在监狱了解到外面的战事,自觉不能袖手旁观,而且他看全世界的魔军都往天维跑,认为众人可能会有麻烦,所以趁乱越狱特来相助。
魔帝炸开残骸,布莱克打算跟魔帝算账,对震远他们说就算这个世界再怎么不堪也不能让它堕入黑暗,当年我没能做出正确的选择,现在我必须纠正这个错误。魔帝说没用的棋子也就没有保留价值,当年没有害他性命,现在清理掉也不晚。布莱克以反负能量的黑曜石装备迎战魔帝,魔帝惊讶凡人居然可以抵挡和破坏自己的攻击,之后才知道布莱克的手杖里有黑曜石剑刃,震远见布莱克举枪要打魔帝,提醒布莱克魔帝是负能量所化没有筋络,反法力科技对魔帝没用,魔帝也自言布莱克愚蠢,还寄望于反法力科技,但攻击却十分有效,布莱克说自己是有备而来,并解释说这不是反法力科技,而是黑曜石灵能武器,提取并导引黑曜石的灵力进行灵能攻击,是专门针对魔帝和暗黑御林军这样的负能量造物所研发的最新黑曜石技术(此技术在第二部中将被普及到黑曜石部队)。但黑曜石的力量终究无法和魔帝相抗,布莱克很快战败受伤,此时各国的防御即将达到极限,九州之心的强化时限也即将过半,众人击败魔帝的希望越来越渺茫。魔帝知道最后一颗光珠是希望光珠,为了避免它被点亮开始以绝对的黑暗压制众人,意图摧毁众人的意志让他们失去战胜自己的希望,他升到空中以君临天下之气势不仅对众人进行灵力压制,更以大法力在各国各地的战线召唤出大批黑暗军团继续攻击成功抵挡住数轮魔军冲击的疲惫不堪支离破碎的人类军队,这些让众人和刚刚以极大代价全歼人间魔军残军的各国军队都陷入了绝望之中,震远更是担忧,因为一旦时限过去吸收号就不能收化黑颅骨,就算众人能想出办法击败魔帝也没用了。面对根本无法抵抗的终极黑暗,重伤的众人互相搀扶着重新站起来聚到震远身边问他现在怎么办,震远没有回答,只是默默地站在那里,他也不知道接下来该怎么办了,现在一切的战略和战术在魔帝绝对的力量面前都是没用的,在任何时候都能时刻保持乐观心态的震远此刻也和众人一样陷入无措和绝望之中。
魔帝继续狂言逼迫众人放弃,但震远没有一直消沉下去,决定尝试最后的抗争,他见光珠还未点亮,遂试图重置歼灭阵法,虽然五行神将已经牺牲,但可以让五位魔将代替他们的位置,以六将军和其余众人的力量代替五行大阵的作用并为阵法提供额外的灵力加持,虽然很牵强也不知道这样能否顺利启动,但只要不违背大阵的运作原理的话理论上应该是可行的,同时让太极将军以太极神功把众人不同种类的灵力进行融合,如此一来阵法的攻击力应该会更强,他不相信这么多人的力量合力一击还敌不过魔帝,大家也只能破釜沉舟准备一试。在众人的全力配合下歼灭大阵成功启动,所有人的灵力融合在一起聚焦攻击确实让魔帝受到了重创,但仍然没有被消灭,这下震远再也想不出任何可行的办法了,魔帝说众人愚蠢至极,五千年前三界众圣合力都奈何不得只有两万年法力的自己,倾尽全力最后也只是封了我的法身,现在自己拥有七万年的力量,众人根本不可能击败自己,再怎么反抗都是徒劳。震远环顾四周,众人皆筋疲力尽垂头丧气,但就在大家即将放弃希望之际,震远受到刚刚魔帝话语的提醒,似乎明白了为什么魔帝总也无法被击败,太极将军说得对,魔帝和刚刚的黑暗战士一样都是负能量的化身,在魔宫魔帝被核弹直接命中暴露在如此高温和强大的物理伤害下都没事,同时想起太极将军在自己回天维后说的物理攻击不能摧毁精神的话,而且之后魔帝又能进入和逃出灵界,可以说现在的魔帝就是纯粹的负能量,是一切负面精神的代表。这段时间自己只顾着以布阵这个办法去击败魔帝,却忘记了自己负防理念的核心要义,以至于从始至终一直都想着用物质上的力量去打击精神当然是收效甚微,因为物质始终是无法彻底战胜精神的,必须要用精神去对抗精神,这是自己从小就总结出的道理,只有相信并着手去创造希望的意志才能驱散黑暗的阴云。想到这里,震远坚定的意志再次让权杖放出了万丈光芒,他趁着这股力量随即准备对魔帝释放终之权杖,大家看到权杖的光感受到一种特殊的暖意,也感受到了震远的心意,随即也纷纷燃起希望之火,不同的是这次众人也跟随震远一起握住权杖。战芸首先行动,她明白如果有什么可以击败魔帝,那就是众人热忱的心和不灭的意志,随后雪月星廉及四战王也一起加入,他们多次见证了震远以内心的力量扭转局势,每次震远都能在绝望中给予人们希望,他们相信震远,相信这次大家的意志集中起来一定也会创造奇迹,而众魔将、六将军以及现场所有人都感受到了众人内心的力量而纷纷在内心作出回应,全世界的军队即使面对这样的绝境也愿意相信震远和天维众人,仍然坚持抵抗的意志凝聚在一起,权杖上最后一颗希望光珠终于被点亮。这时太极将军道出其实八颗光珠并非某种钥匙而只是一个衡量精神正能量的标准,光明核心只是一个转化媒介,所谓的无限光明之力其实就是当人们万众一心时光明核心对此产生的回应,而永恒不灭的热忱之心才是冲破一切黑暗的真正力量。影刃王终于明白为什么光明核心选择震远当它的主人以及四极龙为什么选择震远做光明力量的继承者,因为他始终乐观向上,当其他人都绝望时他却可以保持热忱并将温暖和希望给予他人,从接触他开始自己一直以来都能感受的到,如果有谁能点亮全部的八颗光珠,那就是他了。八颗光珠集齐后光明核心释放出无穷的光明力量直冲魔帝,这股力量已经远远超越了先前六颗光珠的终之权杖,而这八颗光珠全部点亮后的终之权杖所发挥的才是此招的最强力量。魔帝也惧怕起来,遂架起黑暗令牌运足全力艰难抵抗,不明白自己明明已经即将获胜,为什么又会濒临失败,不明白为什么众人在如此的终极黑暗之下还能重燃希望,震远说人类的希望之火不是黑暗可以灭绝的,虽然你逞强一时,但邪不胜正,我们总有办法治你。魔帝又说你以为消灭了我就结束了吗?负能量始终都会存在,世间的黑暗势力层出不穷,你是消不尽灭不绝的。震远说你错了,我并没有要消灭负能量,我只负责维护世间的光影平衡,有光就有暗,这就意味着我永远也不会失业!魔帝虽然不敌核心的无限力量,但在如此强大的光子灵能的冲击下法身仍始终难被摧毁,众人包括六将军等人都不解这种情况下为何魔帝还不灰飞烟灭,此刻战芸眼前突现轩辕黄帝的幻象,他说将轩辕剑置于光明核心的能量之中,藉由这股光明之力化剑为光,就能摧毁魔帝的法身。随即战芸将代表人间正道的轩辕剑投入光明核心的光束中化剑为光击毁了黑暗令牌并击穿魔帝法身将其彻底摧毁,其本体黑颅骨欲逃走,震远及时用吸收号以大法力将其收化永绝后患,魔帝毁灭后他的黑暗军团也尽数灰飞烟灭,黑云黑雾也都散去了,人间重新恢复光明,一切都结束了。
黑暗战争结束后,各界力量也陆续回到了他们各自的领域,魔帝被灭后他对魔界的影响也停止了,众魔将也要回去重塑被魔帝搅乱的魔界,虽然震远有心挽留,希望他们以法力者的身份加入负防局,一起重建人魔两界,共同应对未来的各种危机。但影刃王他们谢绝了震远的邀请,天维的确是人间的法力者之家,可不论如何我等也是战争的罪人,无颜面对人间公众,所以还是回去魔界最合适,但他们也会常关注人间,在暗处协助负防局保护人魔两界。而月灵将军决定不回魔界了,她喜欢人间并且热爱天维这个集体,想加入负防局和天维众人一起生活,而且自己的特殊能力(利用灵界在任何空间来去自如)注定了自己将成为人魔两界的外交大使。离别之际,雪月问震远就这样让魔界众人回去真的好吗,夏炎也提醒震远影刃王持有魔刀影刃,万一……影刃王请大家放心,自己虽手持杀人之刀,却并无杀人之心,况且自己原本一直追求的就是魔界的统一而并非战争,而这几位魔将也并非好战之徒。随后他说自知被魔帝蒙蔽而走错了路,此次回去就是要带着众魔将重整魔界,并代表他们各自的部族和人间结盟修好,和负防局的各位共同抵御一切黑暗势力,包括来自魔界的。魔将们走后,震远左右思量着自己的未来,其实总帅的位子本是自己为了带领人类消除魔军威胁所必需争取的,但自己一直都只是想做点好事和力所能及的贡献因而本就不贪图这种地位,而且战争结束了自己对军权也就毫无兴趣,自己也不会管理军队,现在自己的影响力足够了,魔军也已经被消灭了,随即毅然放弃联军总帅的高位。震远决定次日就向安理会辞职,交出世界军民给自己的世界级军权,要求只保留自己天维负防局的领导权好让他继续主持各种负防工作,发展天维团结世界,完成自己人间天庭的梦想。